Während der Infiltration des Instituts wird Ältester Maxson dem Spieler befehlen, Dr. Li zu kontaktieren und sie dazu überreden, bei einem „Spezialprojekt“ der Stählernen Bruderschaft mitzuarbeiten. Nun begibt man sich in das Institut in die Abteilung Fortschrittliche Systeme und sagt Li, dass man sie finden soll (oder man kann ihr direkt sagen, dass die Bruderschaft einen geschickt hat).
Es gibt auch eine Sprachherausforderung (Orange/Rot) bei der man sie fragen kann, ob sie auf ihrem momentanen Posten glücklich ist, gefolgt von einer Serie schwerer Sprachherausforderungen. Stimmt sie zu mitzukommen, überspringt man das letzte Ziel der Quest. Ansonsten kann man zustimmen, Beweise für Brian Virgils Verschwinden aus dem Institut zu finden.
Um Dr. Lis Vertrauen zu gewinnen, muss man zustimmen, Beweise bezüglich eines Unfalls, der einen ihre Kollegen angeblich getötet hat, zu finden. Sein früheres Labor ist in einem versiegelten Teil der Abteilung Biowissenschaft. Es gibt einen Hintereingang mit einem Terminal (Meister), durch das man direkt zum Hauptraum kommt (und alle Gegner umgeht) und einen Haupteingang am Ende scheinbar verlassener Lagerräume, hinter einer verschlossenen Tür (Anfänger). Sobald man im Labor ist, geht man durch bis zum letzten Raum, wo das Holoband Brian Virgil, persönlicher Eintrag 0176 gefunden wird, welches man zu Dr. Li bringen muss. Das Labor wird von mehreren Geschütztürmen und einem stufen-abhängigen Assaultron bewacht wird, der für niedrigstufige Spieler schwer zu besiegen ist. Im letzten Raum kann man das Holoband in einem Terminal finden. Wenn man dort ist, kann man auch Virgils Serum auf einem nahegelegenen Tisch mitnehmen, um seine Nebenquest abzuschließen.
Jetzt kehrt man zu Dr. Li zurück und gibt ihr das Holoband und macht dann mit Ab in die Anstalt weiter. Sobald man das Institut verlassen hat, kehrt man zur Prydwen zurück und spricht mit Ältester Maxson.
Wird man während dieser Quest aus dem Institut verbannt, wird Ältester Maxson darüber sehr erzürnt sein und wird den Spieler von einem Plan B erzählen. Die Bruderschafts-Questreihe wird dann damit weitergehen, dass man Doctor Scara aus dem Diamond CityScience Center dazu bringt, für die Bruderschaft zu arbeiten.
Läuft Dr. Li zur Bruderschaft über, nimmt Evan Watson ihren Platz als Anführer der Abteilung Fortgeschrittene Systeme des Instituts ein.
Fehler[]
Ist diese Quest zur selben Zeit aktiv wie Ab in die Anstalt, wird der Spieler nicht das Institut-Schnellreise-Upgrade von Dr. Li erhalten und wird das Institut nicht verlassen können; dies kann "behoben" werden, indem man einen Wissenschaftler angreift, da dies dazu führt, dass man aus dem Institut geworfen wird. [bestätigt]
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Ist diese Quest zur selben Zeit aktiv wie Ab in die Anstalt, wird der Spieler nicht das Institut-Schnellreise-Upgrade von Dr. Li erhalten und wird das Institut nicht verlassen können; dies kann "behoben" werden, indem man einen Wissenschaftler angreift, da dies dazu führt, dass man aus dem Institut geworfen wird. [bestätigt]